当Windows服务器上的安全设置不允许下载文件时，这通常是由于IE浏览器的安全级别设置过高，禁用了文件下载功能，以下是一些解决方法：
1、调整IE浏览器的安全级别
打开IE浏览器，点击上方的“工具”菜单（或按Alt键显示菜单栏），然后选择“Internet选项”。
在“Internet选项”窗口中，切换到“安全”选项卡。
点击“自定义级别”按钮，进入“安全设置”窗口。
在“安全设置”窗口中，找到“文件下载”选项，将其设置为“启用”。
为了方便操作，可以将“文件下载自动提示”设置为“禁用”。
将最下方的“重置自定义级别”设置为“安全级-中”，或者直接点击“默认级别”，然后点击“确定”退出。
2、修改注册表
运行regedit，打开注册表编辑器。
定位到HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Internet Settings\Zones\3。
在右侧窗口中找到1803这个DWORD值，默认为0，如果被修改了，将其改成0即可。
3、关闭IE增强的安全配置
如果问题是由于IE增强的安全配置导致的，可以在控制面板中进行设置。
开始菜单——>控制面板——添加或删除程序——添加或删除windows组件——勾选Internet Explorer增强的安全配置——点击详细信息——取消勾选管理员组使用——确定——下一步——完成。
4、检查FTP和IIS设置
如果问题出现在使用FTP协议下载文件时，可能是由于FTP站点的安全设置或IIS服务器的配置问题。
对于FTP站点，可以尝试在资源管理器中使用ftp协议下载文件时，选择“下载”并启用文件下载选项。
对于IIS服务器，需要确保已正确配置MIME类型，以支持所需下载的文件类型。
通过以上步骤可以解决Windows服务器上因安全设置不允许下载文件的问题，如果在尝试上述方法后仍然无法解决问题，建议检查服务器的其他安全设置或咨询专业技术支持。